В настоящее время Томский областной краеведческий музей имени Михаила Бонифатьевича Шатилова является крупнейшим учреждением культуры на территории Томской области.
В состав ТОКМ входят отделы не только на территории города Томска, но и на территории Томской области.
Приближается к своему столетнему юбилею Томский областной краеведческий музей – «зеркало» нашего края, хранитель его истории, одно из старейших учреждений культуры Томской области.
Учрежден в 1989 году и размещается в здании следственной тюрьмы ОГПУ-НКВД (1923-1944 гг.).
Отдел Томского областного краеведческого музея в г. Асино Томской области.
Создан на базе Нарымского окружного музея краеведения, перевезённого из с. Парабели в административный центр Нарымского округа – раб. пос. Колпашево осенью 1936 г.
Отдел ТОКМ вырос из музея Подгорненской средней школы, организованного учителем географии, ветераном Великой Отечественной войны, Крыцыным Никитой Поликарповичем.
Музейный архив, являясь научным подразделением Томского областного краеведческого музея, хранит исключительные по своей значимости документальные богатства.
Библиотека музея (пер. Спортивный, 13 / ул. Гоголя, 31)
ведет свою историю с момента открытия музея в 1922 году.
Музей «Точка гравитации» — это современное технологически оснащенное пространство, в котором посетители вне зависимости от возраста и статуса могли бы в буквальном смысле прикоснуться к основам науки
В 2018 году Томский областной краеведческий музей стал общественным филиалом Музея Победы.